Naruto Uzumaki è un ragazzo dodicenne del villaggio di
Konoha, sede dei ninja del Paese del Fuoco, che insegue il sogno
di diventare Hokage, cioè ninja più forte nonché capo del
villaggio. Il giovane custodisce in sé un segreto di cui lui
stesso è all'osvita, il demone della Volpe a nove code dentro il
corpo di suo figlio (Naruto è il figlio del Quarto Hokage anche
se lui ne è all' oscuro per molto tempo). Da quel momento in
poi, nonostante che il quarto Hokage volesse che Naruto fosse
considerato un eroe nonchè il vero salvatore del Villaggio,
Naruto fu sempre associato da tutti gli abitanti del villaggio
allo spirito demoniaco che viveva in lui e perciò crebbe isolato
da tutti, nonostante nessuno, per legge, potesse parlare del suo
segreto. Il ragazzo crebbe così senza riuscire a spiegarsi il
motivo della sua emarginazione. Così, per poter attirare su di
sé un po' di attenzione, iniziò a comportarsi da teppista,
fingendosi sempre allegro e tentando di nascondere l'enorme
sofferenza patita per la propria solitudine e per l'odio nutrito
verso di lui dagli abitanti del villaggio. In questo frattempo
Naruto venne anche bocciato per la terza volta all'esame
dell'accademia per il diploma di Genin, a cui lui teneva molto,
dopo questa delusione profonda il suo dolore interno aumentò
ulteriormente. Questa situazione cambiò radicalmente quando il
suo maestro Iruka Umino, l'unico ad aver compreso i veri
sentimenti di Naruto, gli salva la vita dal maestro Mizuki, un
traditore che, con un inganno, aveva spinto il ragazzo a rubare
un prezioso rotolo, il quale un tempo apparteneva al primo
Hokage nonchè fondatore di Konoha, contenente delle tecniche
proibite. In questo frangente, Naruto viene finalmente a
scoprire il segreto finora taciutogli del demone che porta
dentro di sé e sul motivo della sua emarginazione. Questo, unito
al desiderio di salvare il maestro Iruka, gli dà la spinta
necessaria a sconfiggere Mizuki con l'unica tecnica che era
riuscito ad apprendere dal rotolo, la Tecnica Superiore della
moltiplicazione del corpo, che in seguito diventerà la sua
tecnica più utilizzata. Grazie a questa dimostrazione di
coraggio e di capacità, il ragazzo riesce anche a guadagnarsi la
promozione, finora rifiutatagli, a Genin (ninja novizio) dallo
stesso Iruka, diventando ufficialmente un ninja. Naruto entra
così a far parte del Team 7 insieme a Sakura Haruno e Sasuke
Uchiha, sotto la guida del maestro jonin Kakashi Hatake.<br>
Al Team 7, come tutte le altre squadre di ghenin vengono
affidate missioni di livello D, cioè missioni semplici come
ritrovare degli animali o aiutare nei lavori domestici e altre
semplici cose. Ma dopo le lamentele di Naruto nei confronti del
Terzo Hokage, viene affidata una missione di livello C che sono
più complicate, la missione riguarda di proteggere Tazuna, un
costruttore di ponti del Paese delle Onde, nel suo ritorno verso
casa. Ma la missione diventa di livello B quando si scopre che
Tazuna è preso di mira da Gatoo, un imprenditore senza scrupoli,
che ha assoldato due ninja per ucciderlo, Zabuza Momochi,
traditore del Villaggio della Nebbia, e Haku, il suo giovane
compagno. Al primo incontro il team 7 ha la meglio arrivando
quasi a sconfiggere Zabusa che poi viene salvato da Haku facendo
la sua prima apparizione e fingendo di uccidere Zabusa. Quando
Zabusa si riprende torna a scontrarsi con il team 7 che si era
accampato nella casa di Tazuna, nello scontro Kakashi se la vede
con Zabuza, faticando non poco per ucciderlo, mentre Naruto e
Sasuke affrontano Haku. Durante la battaglia, Sasuke, sebbene
abbia attivato per la prima volta lo Sharingan, viene quasi
ucciso, e per questo motivo Naruto perde il controllo dalla
rabbia sprigionata, liberando parte del chakra della Volpe a
Nove Code. Prima che Naruto possa ucciderlo, però, Haku
sacrifica la propria vita per salvare Zabuza da Kakashi. In quel
momento Gatoo rivela di non aver intenzione di pagare per la
missione, e cerca di farlo uccidere dai suoi scagnozzi, tuttavia
Zabuza, prima di morire, riesce a eliminare Gatoo. Di
conseguenza Tazuna riesce a costruisce il ponte chiamandolo
&quot;Ponte Naruto&quot;, dato i suoi indispensabili aiuti. Il Team 7
seppellisce assieme i due ninja, e fa ritorno al Villaggio della
Foglia.
Naruto e i suoi compagni dopo la missione del paese delle Onde
affrontano l'Esame di selezione dei Chunin, che si divide in tre
prove guidate da degli esaminatori che sono jonin speciali del
villaggio della Foglia, la prima guidata da Ibiki Morino
comprende un esame scritto il quale riesce a sorpassare il team
di Kakashi, di Asuma, di Kurenai e di Gai, che possiede allievi
eccezionali e molto particolari, questo è per quanto riguarda il
villaggio della Foglia. Il secondo test riguarda una prova di
sopravvivenza dove i partecipanti devono sopravvivere per cinque
giorni nella foresta della morte, inoltre devono raccogliendo
due rotoli, in questa prova compare un nuovo nemico di nome
Orochimaru che in futuro diventerà l'antagonista principale,
entra in azione e in uno scontro ravvicinato, sotto le sembianze
di una kunoichi del villaggio dell'Erba trasmette a Sasuke
Uchiha il Segno maledetto. Nella prima parte della seconda
prova, anche se con molte difficolta passano gli stessi Genin
della foglia che avevano superato il primo test. Ma la seconda
parte della seconda prova che prevede scontri uno contro l'altro
sono in nove a superarlo: Naruto Uzumaki, Sasuke Uchiha,
Shikamaru Nara, Neji Hyuga, Shino Aburame, Gaara, Kankuro,
Temari e Kinuta Dosu. La terza fase dell'esame prevede, dopo un
mese di pausa, un torneo con dei duelli frontali nel quale verrà
identificato se i genin hanno le doti neccessarie per diventare
chunin. In questo mese Naruto incontra Jiraiya, che è uno dei
tre ninja leggendari di Konoha, che gli insegna a controllare e
usare l'immenso chakra della volpe a nove code e la tecnica del
richiamo. Nel frattempo il Villaggio della Sabbia prende un
accordo segreto con il Villaggio del Suono in concordanza col
quale i due villaggi si coalizzano nel tentativo di distruggere
Konoha: il piano viene attuato durante lo scontro tra Sasuke e
Gaara.
Il Villaggio della Foglia viene invaso e Orochimaru,
intrufolatosi sotto le mentite spoglie del Quarto Kazekage, con
l'aiuto del Quartetto del suono, combatte il Terzo Hokage.
Durante lo scontro vengono resuscitate le anime del Primo e del
Secondo Hokage, usate da Orochimaru come armi da combattimento.
Alla fine della battaglia il Terzo Hokage utilizza il Sigillo
del Diavolo per poter intrappolare per l'eternità l'anima di
Orochimaru, ma muore riuscendo a privarlo dell'uso delle braccia
e quindi privandolo di qualsiasi tecnica. Naruto, nel frattempo,
insegue Sasuke che stà cercando di trovare Gaara per batterlo.
Naruto, arriva quando Sasuke stà per morire e lo salva, poi con
l'aiuto di Gamabunta, il Signore dei Rospi evocato con la
tecnica del richiamo, riesce a sconfiggere il ninja della
Sabbia, il quale si era rivelato una Forza Portante come Naruto:
nel corpo di Gaara si annida infatti lo spirito del Demone Tasso
ad Una Coda. Naruto riesce così a salvare Sakura, la quale era
stata intrappolata dal mostro. Il Villaggio riesce nel frattempo
a respingere l'invasione grazie ad una potente controffensiva
lanciata nel frattempo dai Jonin. Subito dopo l'invasione viene
celebrato il funerale del Terzo Hokage e degli altri ninja che
hanno perso la vita durante lo scontro.
Pochi giorni dopo la fine del torneo si presenta un'ulteriore
pericolo, costituito da due dei membri dell'Organizzazione Alba:
Kisame Hoshigaki, uno dei sette spadaccini della nebbia, che usa
una spada chiamata pelle di squalo per trinciare l'avversario e
per assorbirgli il chakra e Itachi Uchiha, nonchè fratello di
Sasuke Uchiha il quale vive per vendicarsi e quindi eliminare
Itachi Uchiha per aver eliminato l'intero clan, Itachi possiede
lo Sharingan con tre tomoe come Kakashi Hatake. Questi due ninja
sono due ninja traditori, Kisame della Nebbia e Itachi di Konoha,
sono di rango S cioè più potenti dei Jonin. appena arrivati
vengono trovati da Asuma Sarutobi, Kurenai Yuhi, Kakashi Hatake
e Gai Maito e cominciano un combattimento di altissimo livello.
Durante la battaglia, Itachi mostra a Kakashi il suo vero
potere: lo Sharingan Ipnotico: Questo è il livello più alto di
uno Sharingan e solo pochissime persone in tutta la storia del
Clan Uchiha possono vantare il raggiungimento di tale livello,
infatti per possederlo bisogna uccidere il miglior amico(lo
Sharingan acquisito dopo aver ucciso il proprio migliore amico
si chiama Mangekyou Sharingan) . Con un solo sguardo, Itachi fa
sprofondare Kakashi in un profondo coma, dopo averlo trafitto
con una spada per tre giorni nella dimensione da lui creata
(infatti attivando lo Sharingan ipnotico Itachi va con
l'avversario in un'altra dimensione chiamata Luna Insanguinata
nella quale un secondo del tempo reale è uguale ad un giorno in
quella dimensione); tuttavia, subito dopo l'arrivo di Gai,
Itachi fugge insieme al compagno allo scopo di andare alla
ricerca del loro obiettivo: il demone racchiuso in Naruto, che
nel frattempo sta partendo con Jiraiya per ritrovare Tsunade,
unica persona papabile per il ruolo di Hokage. Itachi e Kisame
rintracciano Naruto, ma vengono rallentati da Sasuke, il quale
soddisfatto di aver ritrovato Itachi per vendicarsi. Però riceve
una pesante sconfitta da parte di lui stesso, in seguito Kisame
e Itachi vengono imprigionati da Jiraiya nella Tecnica della
prigionia dell'intestino del rospo. Solo grazie all'ausilio
dell'Amaterasu di Itachi, una tecnica esclusiva dei possessori
dello Sharingan Ipnotico che crea delle fiamme nere capaci di
distruggere qualsiasi cosa per sette giorni e sette notti, i due
riescono a fuggire.
Dopo l'incontro con i membri dell'Organizzazione Alba, Naruto e
Jiraiya riprendono il viaggio alla ricerca di Tsunade, per
proporle di diventare Quinto Hokage del Villaggio della Foglia.
Nel frattempo l'Eremita dei Rospi, attraverso un allenamento
speciale, insegna al suo allievo la tecnica del Rasengan, che
completerà in seguito. Tsunade è allo stesso tempo ricercata da
Orochimaru e il suo braccio destro Kabuto Yakushi i quali, dopo
averla trovata, le propongono di curare le braccia di Orochimaru,
danneggiate nel corso dello scontro con il Terzo Hokage, in
cambio della promessa da parte di Orochimaru di riportare in
vita suo fratello e l'uomo che ha tanto amato. Lo stesso giorno
Jiraiya e Naruto trovano la donna che subito ingagga una breve
sfida contro Naruto, a causa dei suoi insulti nei confronti
degli Hokage e al quale facendoci una scommessa darà una
settimana di tempo per mostrargli la tecnica completa del
Rasengan, fin ad allora completa solo a metà. Qualche giorno
dopo Tsunade, rincontratasi con il suo ex-compagno di Team
Orochimaru, dichiara di rifiutare l'offerta di Orochimaru, e
perciò comincia a combattere contro di lui; al combattimento si
aggiungeranno sia Naruto,Jiraiya e Shizune, l'assistente di
Tsunade che racconta dell'incontro precedente con Orochimaru e
dell'offerta da lui fatta a Tsunade. Orochimaru, intuendo che
Naruto rappresenterebbe un serio pericolo se cadesse nelle mani
dell'Organizzazione Alba, decide di ucciderlo; ma Tsunade,
capendo le intenzioni dell'avversario e superata l'emofobia che
in precedenza nello scontro l'aveva penalizzata, cerca in ogni
modo di proteggere Naruto, in quel momento privo di sensi dopo
essersi scontrato con Kabuto. Inizia la parte finale della
battaglia dove Jiraiya evocherà Gamabunta, Tsunade Katsuyu,
Regina delle Lumache, e Orochimaru Manda, il Signore dei
Serpenti. Orochimaru ha la peggio e dopo una sequenza di colpi
devastanti di Tsunade, la quale è maestra di Taijutsu nonché la
donna più forte del mondo, è costretto a battere in ritirata.<br>
Dopo qualche tempo si ripresenta a Konoha il Quartetto del
suono, proponendo a Sasuke di andare con loro per ottenere il
potere di Orochimaru, il quale però vuole solo utilizzare il
ragazzo come contenitore per la sua anima, dato che quello
vecchio era stato danneggiato dalla Tecnica del Terzo Hokage.
Sotto la guida del ninja leggendario, a loro parere, il ragazzo
diventerebbe più forte e potrebbe imparare tutto ciò che al
Villaggio della Foglia non imparerebbe mai. Sasuke si lascia
convincere, animato dal desiderio sfrenato di vendicarsi ed
uccidere suo fratello Itachi Uchiha, responsabile dello
sterminio di tutto il suo clan. Prima di andarsene però viene
fermato da Sakura, la quale con un gesto disperato tenta di
fermarlo, ma non ci riesce. Tsunade, appena appresa la notizia
ordina a Shikamaru di creare una squadra per la missione di
salvataggio di Sasuke e lui sceglie i seguenti membri: Naruto,
Choji, Neji e Kiba (ai quali in seguito si aggiungerà Rock Lee),
Kankuro, Gaara e Temari. Prima di partire, Naruto dopo le
imploranze di Sakura gli giura sulla sua stessa vita che avrebbe
riportato indietro Sasuke costi quel che costi. Durante
l'inseguimento ognuno dei componenti della missione si ferma per
combattere contro un membro del Quartetto: Choji si occupa di
Jirobo, Neji di Kidomarou, Kiba di Sakon e suo gemello siamese
Ukon e Shikamaru di Tayuya, mentre Naruto combatte con Kimimaro.
In seguito Rock Lee giunge in supporto di Naruto permettendogli
di andare all'inseguimento di Sasuke , mentre i ninja della
Sabbia, Gaara, Temari e Kankuro, aiuteranno rispettivamente Rock
Lee, Shikamaru e Kiba. Kimimaro prevale su Rock Lee ma
interviene Gaara che lo sostituisce, Kimimaro muore stroncato
dalla sua grave malattia (stava facendo la sua ultima battaglia
per portare il suo sostituto Sasuke da Orochimaru).Intanto
Naruto stà andando avanti e si ritrova nella Valle della Fine a
combattere contro il suo migliore amico. La battaglia,
combattuta da entrambi i lati al massimo delle forze, Naruto
evocando il chakra della volpe a nove code e Sasuke quello del
segno maledetto al secondo livello avendolo appena ottenuto, si
conclude con la vittoria di Sasuke, che però non uccide Naruto
dato che è diventato il suo miglior amico, perchè è il più
simile a lui, quindi rinunciando involontariamente allo
Sharingan Ipnotico dicendo che riuscirà ad ottenere potere senza
questo Sharingan, lascia il suo amico svenuto. Naruto viene
riportato a Konoha insieme a tutti gli altri del Team Shikamaru.
Durante la riabilitazione all'ospedale Naruto rinnova la
promessa fatta a Sakura di riportare Sasuke al villaggio anche a
costo della propria vita; Jiraiya si offre di supervisionare
l'allenamento del Genin per due anni e mezzo, e dopo una lunga
discussione Naruto accetta. La narrazione del manga si
interrompe per lasciar spazio al Kakashi Gaiden, breve storia in
6 capitoli che narra di come Kakashi abbia ottenuto il suo
Sharingan. Nell'anime invece trovano spazio 84 episodi in cui
sono narrate storie che non hanno alcun collegamento con la
trama principale e che servono solo ad allungare la serie 1
filler.